绿色食品采用的是全过程“从土地到餐桌”的质量安全管理:

包括产地环境管理，强调出自最佳生态环境;农业投入品管理，种子、肥料、兽药、饲料等各种农业投入品都要符合食品安全要求;农业生产过程中各环节的质量安全管理，如对植物性农产品的播种、培育、生长和收获整个过程的质量安全管理，对动物性农产品在屠宰或加工前的所有阶段包括饲养、捕获、捕鱼、挤奶等过程中质量安全管理:农产品加工中的质量安全管理，如在加热、烘干、熏烤、腌制、提取、挤压等处理过程的质量安全管理。

绿色食品的全程管理方式，有效地保障了食品安全。饮食与健康密切相关，随着食品质量的改善，将促进人们健康水平的提高。据专家估计，福建省因推广绿色食品而减少食物中毒或者因食用不安全食品造成的其他病患，减少相应的医疗支出每年可达5000万元。